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AI如何讓失敗藥物“起死回生”?

[日期:2025-04-08] 作者:生物谷 次瀏覽 [字體: ]

人工智能已在藥物發(fā)現(xiàn)領域帶來了巨大變革,越來越多的生物制藥公司開始采用AI技術以加速并優(yōu)化研發(fā)流程。

AI已經用于老藥新用——尋找針對某一疾病開發(fā)的藥物是否有用于其他疾病的可能性。通過快速分析海量生物醫(yī)學數據,AI能夠迅速挖掘出藥物和疾病的隱秘關聯(lián),并預測哪些現(xiàn)有藥物在新的治療方向上可能取得成功。在這一過程中,機器學習可用于預測藥物與新靶點的結合強度,而深度學習則能設計出針對特定疾病優(yōu)化的新型分子結構。

而對于失敗的分子,AI有望使其重回臨床試驗。數據顯示,約有90%的藥物在臨床試驗中失敗。失敗的原因通常是未能達到預設療效目標,或在安全性方面出現(xiàn)問題,從而被研發(fā)公司擱置。

挽救失敗分子的風險和成本十分高昂,在沒有AI技術的年代,新藥失敗后通常會被直接丟棄。如Ignota Labs聯(lián)合創(chuàng)始人兼首席科學官(CSO)Jordan Lane所說:“比如解決毒性問題,意味著需要在實驗室中測試大量復雜機制和終點指標,而這些往往需要巨大的時間和資金投入?!?/p>

但如今,一些公司看到了轉機:借助AI的力量,有望“挽救”那些依然具有潛力、但曾因安全性或療效問題而失敗的藥物。本文將以Ignota Labs和BioXcel Therapeutics公司為例,探討AI如何重新挖掘因安全性或療效問題而中止的新藥的潛力。

解決毒性問題,AI讓新藥重回臨床

Ignota Labs是一家特別的新藥公司——他們挑選曾經失敗的藥物,找出并解決其毒性問題,然后重新推進臨床試驗,讓藥物重新走向市場,服務真正需要的患者。

藥物安全性問題是導致臨床試驗失敗的主要原因之一。Ignota Labs成立之初,試圖向其他公司推銷AI解決新藥毒性問題的服務,但發(fā)現(xiàn)很難說服Biotech公司花錢聽他們說自家的藥物可能存在毒性。

現(xiàn)在,Ignota轉向主動出擊,自行收購這類“困境資產”,將其納入自家研發(fā)管線,并借助AI技術解決毒性問題,并開發(fā)使其能夠在第二次臨床試驗中成功的解決方案。

Jordan Lane解釋說:“藥物失敗往往發(fā)生在人體試驗中,我們需要找到毒性的發(fā)生機制,在更基礎的實驗室測試中重現(xiàn)這種機制,并在新化合物在重新進入臨床試驗前驗證其安全性。同時通過AI預測,確保在解決一個問題同時不引發(fā)新的問題?!?/p>

Ignota開發(fā)的AI技術平臺名為 SAFEPATH,利用深度學習、化學信息學與生物信息學的結合分析藥物安全性問題,提供可操作的解決方案。Lane指出,早期的AI公司往往只專注于化學或生物一方面,而他們認為“兩種技術的交叉將揭示藥物失敗的真實原因”。

詳細的技術原理是,“基于在不同藥物濃度和不同物種的研究,構建了涵蓋超過15000個蛋白質組機器學習模型的化學信息學平臺,用于預測藥物與蛋白質的結合情況——靶標結合和脫靶效應?!比缓髮⑦@些信息輸入生物信息平臺,分析相關通路,通過因果知識圖譜連接各類組學數據庫。

“當我們鎖定一個具體的生物問題時,目標是把藥物結構和終點聯(lián)系起來。通過化學信息、生物信息與濕實驗驗證的結合,建立一個足夠有說服力的假設,從而推動藥物重返臨床?!?/p>

Ignota最近完成了690萬美元的種子輪融資,用于擴展藥物管線,并推進其第一個藥物(PDE9A抑制劑)進入早期臨床試驗。Lane透露,該公司對多款“極具潛力”的藥物的盡職調查已接近尾聲,如果這些藥物的安全性問題能夠得到解決,或將帶來變革。而Ignota也仍在積極收購資產。

二次創(chuàng)新,升級被擱置的新藥

另一家通過AI重新開發(fā)失敗藥物的公司是 BioXcel Therapeutics,與Ignota不完全相同,BioXcel更專注于那些已在早期試驗中被證實安全,但因各類原因被擱置的化合物。

BioXcel主要關注神經科學領域。由于人類大腦神經系統(tǒng)極其復雜,CNS藥物開發(fā)成功率較低、周期更長,靶點難以確定,研究成果也很難轉化為有效治療方案。

BioXcel公司依托AI平臺NovareAI對已有的CNS新藥或分子進行重新研究和設計,探索二次創(chuàng)新分子在其他CNS適應癥上的潛力。這些分子本身已有一定的研發(fā)基礎,相比從頭開發(fā)新藥,其開發(fā)速度更快、成本更低,成功率更高。

BioXcel的AI藥物發(fā)現(xiàn)副總裁Friso Postma表示,他更愿意稱其平臺為“增強智能”(Augmented Intelligence)而非“人工智能”,因為平臺并非黑箱操作,而是由多個AI工具組成,并在高度人工監(jiān)管下運行。

NovareAI 24小時不間斷運行,持續(xù)篩選已在臨床II期或III期失敗但仍具有改造潛力的藥物,尤其針對CNS適應癥。它會整合所有公開文獻信息,識別藥物、神經通路、行為表現(xiàn)及疾病指征之間的聯(lián)系。這一過程依賴“知識圖譜”,將結構化與非結構化數據融合,并通過自然語言處理、大語言模型等技術理解文本內容。

目前,BioXcel正在研發(fā)兩款新藥:BXCL502(用于緩解阿爾茨海默病相關激越癥狀)和 BXCL503(用于緩解阿爾茨海默病相關淡漠癥狀)。他們還已將鎮(zhèn)痛藥Dexmedetomidine改良為舌下膜劑型,并獲批用于治療精神分裂癥或雙相情感障礙相關的激越癥狀。該藥因其阻斷交感神經“戰(zhàn)斗-逃跑”反應的作用(稱為交感抑制作用),還被視為治療焦慮、恐慌和創(chuàng)傷后應激障礙(PTSD)的潛在藥物。

Postma指出:“IGALMI舌下膜劑從首次人體試驗到獲批僅用了不到四年——這和傳統(tǒng)新藥開發(fā)路徑形成了鮮明對比,后者通常需要10–12年、花費超過12億美元。AI為其帶來巨大的效率提升和資源節(jié)約?!?/p>

結語

當一款新藥在臨床階段宣告失敗,受影響最大的還是等待治療的患者?!芭R床階段的失敗,讓患者錯失了本可能帶來希望的治療方案”,Lane感慨道,“如果能讓這些藥物重返臨床,也就重新點燃了本已熄滅的希望?!?/p>

此外,從頭開發(fā)一款新藥通常需要10-15年,成本平均大約需要11億美元。一旦失敗,不僅時間和金錢打了水漂,過去投入的所有的科研資源也隨之化為烏有。而AI在藥物改造方面的應用,則可能為制藥企業(yè)彌補部分損失,以前所未有的速度為患者帶來更好的治療選擇。